More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00580 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  70.13 
 
 
486 aa  736    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
477 aa  1001    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  55.61 
 
 
446 aa  513  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  51.26 
 
 
471 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  48.51 
 
 
451 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  48.29 
 
 
465 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  45.24 
 
 
461 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 
446 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  40.69 
 
 
462 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 
450 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  41.59 
 
 
452 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 
466 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  37.95 
 
 
479 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  42.08 
 
 
422 aa  317  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  42.08 
 
 
422 aa  317  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  40.53 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 
465 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  37.38 
 
 
460 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  35.02 
 
 
460 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 
481 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 
482 aa  266  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  33.12 
 
 
387 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  32.95 
 
 
357 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  31.45 
 
 
368 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
371 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 
362 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.38 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  29.21 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.53 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 
330 aa  77  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  25.56 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.36 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  22.03 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.1 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.07 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 
325 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 
347 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 
429 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.74 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.55 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  25.18 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
1005 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.97 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  33.8 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 
393 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.47 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
378 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.04 
 
 
367 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.48 
 
 
346 aa  64.7  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 
404 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
380 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
332 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
363 aa  63.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 
376 aa  63.9  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 
357 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.78 
 
 
375 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
389 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.18 
 
 
398 aa  63.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  25.58 
 
 
363 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  21.69 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  28.07 
 
 
1014 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
377 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 
366 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  22.11 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  23.42 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>