More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0601 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  70.13 
 
 		 477 aa  736    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 486 aa  1020    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  53.29 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  54.2 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  46.28 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  41.63 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  40.59 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  38.51 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  37.95 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  40.77 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  37.05 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  41.83 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  41.83 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  35.99 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 482 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  33.72 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  33 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  32.27 
 
 		 357 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 371 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 330 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.5 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 330 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.33 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  27.07 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  27.07 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.4 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  22.66 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.63 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.01 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.68 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  33.55 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  31.55 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.7 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.32 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.68 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  28.35 
 
 		 1014 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.58 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.29 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  29.02 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  25.26 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  23.64 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.5 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  30.23 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>