More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0244 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  959    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  81 
 
 		 465 aa  777    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  84.27 
 
 		 460 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  74.89 
 
 		 460 aa  747    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  42.44 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  43.34 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  44.02 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  42.34 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  41.69 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 		 446 aa  339  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  38.22 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  40.52 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 482 aa  329  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  37.47 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 451 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  38.41 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 486 aa  315  9e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  38.68 
 
 		 477 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  37.18 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  37.18 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  33.77 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  34.26 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  33.96 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 362 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.93 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 327 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  29.03 
 
 		 366 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 496 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 325 aa  97.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.59 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.48 
 
 		 349 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.94 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 330 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 358 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 358 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 363 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 357 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.8 
 
 		 390 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 333 aa  87.4  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 317 aa  87  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  24.69 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  34.56 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.55 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.44 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.45 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  24.78 
 
 		 769 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.58 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26.35 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.26 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.95 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>