More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1163 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  71.19 
 
 		 482 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  997    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  65.2 
 
 		 481 aa  694    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  86.31 
 
 		 482 aa  898    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  71.82 
 
 		 482 aa  771    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  44.87 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  40.63 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  38.97 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  41.45 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  40.72 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  34.89 
 
 		 446 aa  286  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  35.62 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  34.87 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 451 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  37.03 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  36.07 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  36.07 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  33.68 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 		 362 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  31.12 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  33.81 
 
 		 387 aa  147  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 501 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.34 
 
 		 346 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.99 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.25 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  23.62 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.28 
 
 		 769 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.62 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  23.74 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.14 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.16 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  35.95 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.6 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.93 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.68 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.98 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.29 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  34.18 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.89 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  31.44 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.61 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  22.97 
 
 		 335 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>