More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0687 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  974    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 462 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 728 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.64 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.44 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.63 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  21.57 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  22.43 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  31.29 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  27.6 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  27.6 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.73 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  35.17 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  20.5 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  20.73 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  28.92 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  24.74 
 
 		 723 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  22.14 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  25.42 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  26.73 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  32.89 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>