More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0678 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  951    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  32.6 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 462 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 476 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.73 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  35.2 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 728 aa  97.1  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 469 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.38 
 
 		 470 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  34.62 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  33.13 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  36.42 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  31.17 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  30.52 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  31.17 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  34.69 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  30 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  29.22 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  29.22 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.86 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  29.87 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  28.95 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.23 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  31.25 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  31.25 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  26.12 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.2 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.34 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  32.72 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>