290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1683 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  100 
 
 		 460 aa  915    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.97 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.75 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.47 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.47 
 
 		 398 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.47 
 
 		 398 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.47 
 
 		 398 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  29.97 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  29.97 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  29.67 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 370 aa  113  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.78 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.47 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  27.67 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  27.4 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  27.4 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  27.4 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  27.12 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.95 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  27.52 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  27.52 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  25.88 
 
 		 370 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.59 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.59 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 		 374 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  27.94 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.67 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  22.96 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  27.68 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.94 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.94 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.76 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.76 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  26.1 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 407 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.84 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 383 aa  90.5  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 800 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.58 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.48 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.87 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 723 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 794 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>