103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1924 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1924  radical SAM superfamily protein  100 
 
 		 331 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 467 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 815 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 		 464 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 463 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 427 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 463 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  31.3 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 454 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.21 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 443 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 474 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 463 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 444 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  21.18 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  31.96 
 
 		 481 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 452 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 476 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 476 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 444 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.14 
 
 		 510 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 		 394 aa  45.8  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 436 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  26.54 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 468 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 518 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.05 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.68 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  30.6 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  27.63 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  25.15 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  32.97 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 723 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 453 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  30.53 
 
 		 470 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.42 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 781 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 464 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 393 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 447 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 537 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>