More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0266 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  725    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  79.27 
 
 		 356 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  78.43 
 
 		 380 aa  594  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  82.3 
 
 		 270 aa  435  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  52.08 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  46.93 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  46.67 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 356 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  34.3 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 372 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  34.37 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  87.36 
 
 		 102 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  28.99 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  27.58 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 485 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  25.45 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.23 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.72 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.88 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.3 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.79 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.11 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  23.73 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1664  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  20.82 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  31.34 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.51 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  30.23 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.08 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.33 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  27.27 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>