More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1743 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  84.46 
 
 
491 aa  876    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  77.27 
 
 
487 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  99.8 
 
 
491 aa  1008    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 
482 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  93.67 
 
 
491 aa  957    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 
423 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  45.95 
 
 
423 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  45.76 
 
 
420 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  47.8 
 
 
418 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  48.92 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  33.43 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  35.31 
 
 
383 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 
347 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 
360 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.02 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 
414 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
394 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.23 
 
 
479 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.55 
 
 
373 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 
377 aa  136  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.42 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.37 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.51 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
330 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 
406 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
347 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 
363 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.58 
 
 
373 aa  126  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 
347 aa  126  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
356 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
501 aa  126  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 
406 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  28.49 
 
 
375 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 
395 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
380 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
386 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
334 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
396 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
359 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.68 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.78 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  32.37 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
391 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
327 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27 
 
 
358 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  27.12 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
380 aa  120  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.49 
 
 
399 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 
349 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 
418 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 
357 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 
396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 
368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 
368 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.73 
 
 
561 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.62 
 
 
394 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 
409 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
342 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.23 
 
 
379 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
412 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 
409 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 
367 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.45 
 
 
391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 
332 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 
407 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.39 
 
 
390 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.38 
 
 
387 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>