266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0093 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  726    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  58.71 
 
 		 353 aa  441  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  57.58 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  55.96 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  53.46 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  52.08 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  41.5 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  32.63 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  31.82 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  27.73 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 461 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 489 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.84 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.84 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.94 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.45 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 422 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.31 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.62 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.48 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.39 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.09 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  22.09 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.27 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.95 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 565 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 429 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  32.33 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.38 
 
 		 510 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>