More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2880 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  100 
 
 		 383 aa  794    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  59.79 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  57.8 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  54.3 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  57.22 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 		 356 aa  212  9e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 357 aa  193  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  34.24 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  21.59 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.43 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.73 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 465 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.63 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.71 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.54 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  21.67 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  21.88 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  43.24 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.87 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 800 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.17 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.17 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.17 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 476 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  23.55 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>