More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0383 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  779    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  80.62 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  78.43 
 
 		 357 aa  593  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  74.49 
 
 		 270 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  53.46 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 		 353 aa  339  4e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  45.81 
 
 		 350 aa  325  9e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  32.8 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  30.14 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  83.7 
 
 		 102 aa  156  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.33 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.48 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  22.12 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 474 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.32 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  26.64 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.91 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  25.21 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.27 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.15 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.44 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.36 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  23.45 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>