152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0782 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 510 aa  1070    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 469 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.37 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.04 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.08 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  22.61 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  21.13 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  22.35 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.27 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  21.55 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  20.47 
 
 		 467 aa  62  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  20.6 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 344 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.62 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  20.64 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  20.53 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 323 aa  57  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  21.9 
 
 		 728 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  19.67 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  20.33 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  20.53 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  21.29 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  22.13 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  20.85 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  20.53 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  29.05 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  20.27 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 296 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 449 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 480 aa  53.9  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  21.04 
 
 		 405 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 468 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  20.1 
 
 		 481 aa  53.9  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  21.69 
 
 		 457 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  20.1 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  18.72 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  23.45 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  20.83 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  23.45 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  19.95 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  23.45 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.54 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  20.45 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 		 376 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  23.5 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  20.81 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  22.04 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  22.74 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>