More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1017 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  100 
 
 
345 aa  704    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  52.94 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  43.87 
 
 
344 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
365 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.07 
 
 
394 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 
460 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.79 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.07 
 
 
394 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.79 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 
461 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.31 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  25.7 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  26.63 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  27.16 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.69 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.8 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  28.57 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.41 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.7 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.47 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.66 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.5 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.87 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  20.75 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  20.75 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  32.59 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  20.75 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  28.36 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 
400 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.97 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 
510 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  22.55 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  23.48 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  24.78 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.27 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 
486 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  21.07 
 
 
486 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.55 
 
 
432 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.53 
 
 
446 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 
489 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.69 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 
477 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>