15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1334 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  214  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  87.36 
 
 
357 aa  176  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  83.7 
 
 
380 aa  156  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  78.02 
 
 
356 aa  149  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 
350 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  46.51 
 
 
353 aa  93.2  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  91.3  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 
356 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 
356 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  43.24 
 
 
383 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
380 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 
372 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  32.58 
 
 
367 aa  47.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>