227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0349 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  759    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  57.22 
 
 
383 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  55.23 
 
 
380 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  54.96 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  52.82 
 
 
372 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 
350 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  34.37 
 
 
357 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
353 aa  186  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
356 aa  186  7e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
356 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
380 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  28.09 
 
 
395 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  28.1 
 
 
450 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 
461 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 
447 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.93 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
476 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.26 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  23.66 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 
458 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.58 
 
 
484 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 
403 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.02 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 
510 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 
460 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
466 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  28.98 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 
460 aa  59.7  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  30.28 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 
489 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 
485 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 
464 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 
442 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.78 
 
 
457 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 
468 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  21.24 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  31.13 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 
462 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 
518 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
728 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6115  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.7 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  24.12 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 
446 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.24 
 
 
470 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
409 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 
492 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.64 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 
452 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.84 
 
 
446 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.85 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.85 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 
471 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
450 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.17 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>