282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2994 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  100 
 
 
366 aa  758    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  31.66 
 
 
402 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  31.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  31.18 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
385 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  31.18 
 
 
385 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
385 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.84 
 
 
398 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.84 
 
 
398 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.57 
 
 
398 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.57 
 
 
398 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.57 
 
 
398 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  28.05 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  28.05 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
410 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
410 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
391 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  27.08 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  27.08 
 
 
411 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.81 
 
 
411 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 
411 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  26.06 
 
 
411 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  25.8 
 
 
411 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  27.61 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  28.31 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  27.2 
 
 
411 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.13 
 
 
394 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
370 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 
436 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 
436 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.17 
 
 
438 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
436 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.41 
 
 
394 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.13 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
369 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.13 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.87 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.99 
 
 
431 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.6 
 
 
431 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.87 
 
 
447 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
444 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  27.8 
 
 
280 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.6 
 
 
431 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  23.38 
 
 
440 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.06 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.99 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  24.4 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  28.96 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.5 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.93 
 
 
408 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  24.93 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.46 
 
 
396 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.46 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.46 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 
435 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
407 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
428 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 
397 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
290 aa  96.3  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  22.93 
 
 
399 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
374 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 
431 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  32.97 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
403 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.4 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 
800 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  25.91 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  31.85 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 
781 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0138301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>