More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1525 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
381 aa  800    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  65.01 
 
 
387 aa  548  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  63.9 
 
 
389 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  60.88 
 
 
388 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  60.84 
 
 
385 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  60.32 
 
 
380 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  58.42 
 
 
383 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 
800 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.14 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.73 
 
 
438 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
398 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.54 
 
 
398 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 
411 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.46 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.55 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 
435 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  25.53 
 
 
411 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  25.26 
 
 
411 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  22.51 
 
 
433 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.54 
 
 
431 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.54 
 
 
431 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
447 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.54 
 
 
431 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 
435 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  25.27 
 
 
411 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  25.27 
 
 
411 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.27 
 
 
431 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.68 
 
 
385 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 
391 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.68 
 
 
385 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 
385 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.36 
 
 
391 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
385 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
385 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.68 
 
 
385 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.36 
 
 
391 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
385 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  25 
 
 
411 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 
402 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
385 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  24.74 
 
 
411 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 
410 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 
410 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 
431 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 
414 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.44 
 
 
394 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.44 
 
 
394 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  24.28 
 
 
414 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.44 
 
 
394 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.44 
 
 
394 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 
428 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  21.23 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.34 
 
 
280 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.7 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  23.32 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.75 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.87 
 
 
396 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.87 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
470 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.49 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  19.69 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  25.56 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.03 
 
 
457 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1758  Radical SAM domain protein  22.43 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  23.86 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  23.99 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.86 
 
 
510 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24.86 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>