More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0899 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 345 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  38.78 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 		 399 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.44 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  38.24 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  34.81 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 1000 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.3 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 480 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  35.85 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  34.12 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  37.06 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  35 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  35 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.08 
 
 		 410 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  29.34 
 
 		 491 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.98 
 
 		 479 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.92 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  34.66 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  32.99 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  35.33 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  29.74 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  34.32 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.69 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.38 
 
 		 373 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  36.77 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.77 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 1002 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 1005 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.14 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  33.53 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  32.02 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.53 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  32.08 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.38 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  35.71 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  32.62 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>