More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0011 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 338 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  39.37 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.75 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.23 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.3 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.73 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  35.39 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.47 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  35 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.8 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 393 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.77 
 
 		 479 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.75 
 
 		 399 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.14 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  33.53 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.32 
 
 		 394 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 396 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 1002 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  32.97 
 
 		 487 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 496 aa  89.4  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.87 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  35.39 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  25.4 
 
 		 510 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 		 407 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 393 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 		 418 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.52 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  32.43 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  35.68 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  35.33 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.02 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.55 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  27.75 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 1005 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.35 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  29 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  29.35 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.53 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>