More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0426 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  81.15 
 
 
423 aa  732    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  100 
 
 
420 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  80.91 
 
 
423 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  67.65 
 
 
418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
439 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  46.19 
 
 
491 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  45.77 
 
 
487 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 
491 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  44.62 
 
 
482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  36.79 
 
 
510 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
347 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
360 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  29.79 
 
 
383 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 
414 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.84 
 
 
346 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
359 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
363 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
405 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.69 
 
 
349 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.59 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 
381 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
358 aa  136  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 
330 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
330 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.75 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
354 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
334 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
501 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
399 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
398 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 
428 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.45 
 
 
479 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.2 
 
 
390 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
347 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  27.01 
 
 
356 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 
333 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.36 
 
 
335 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
380 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
357 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.14 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.93 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
480 aa  120  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
397 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 
332 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
368 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
349 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.92 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  27.95 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.72 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  26.68 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.15 
 
 
375 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.61 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
375 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 
389 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
382 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.79 
 
 
355 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
429 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
394 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 
319 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 
407 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
393 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
378 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  25.21 
 
 
357 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.49 
 
 
359 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
427 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 
393 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
393 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
384 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 
390 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
381 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 
370 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 
367 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>