More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8972 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 364 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  39.15 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  33.63 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  34.02 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.95 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.4 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 501 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 1005 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.18 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.5 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  24.91 
 
 		 1002 aa  79.7  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  22.8 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.03 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  23.62 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.09 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  29.52 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 468 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  23.94 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 1039 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  21.02 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  23.66 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  21.75 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  22.78 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  22.15 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.71 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.98 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.5 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  21.85 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>