More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4391 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 327 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  71.38 
 
 		 326 aa  504  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  42.76 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  29.03 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  36.77 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.75 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  32.87 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  34.23 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  33.55 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  33.33 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.65 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.19 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  39.76 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.43 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.66 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  36.09 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  33.12 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.72 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.55 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  31.65 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  29.74 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.45 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.16 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.92 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  31.65 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.37 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  28.67 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 501 aa  62.8  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.54 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.19 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.09 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.67 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.92 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  32.39 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  30.92 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  29.37 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>