More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1706 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
516 aa  1052    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  20.78 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
440 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.14 
 
 
346 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.79 
 
 
397 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
414 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 
405 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
399 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
800 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
428 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 
394 aa  97.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.73 
 
 
479 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
496 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
384 aa  93.6  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.23 
 
 
349 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
1002 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.53 
 
 
378 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 
380 aa  90.9  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
398 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
389 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 
391 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 
384 aa  87.8  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.39 
 
 
399 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
415 aa  88.2  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 
393 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
397 aa  87.4  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.32 
 
 
381 aa  87  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.11 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.3 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 
399 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  35.54 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
344 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.53 
 
 
333 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  30.32 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  35.48 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.88 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
323 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.36 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.27 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  33.85 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
1005 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  35.54 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.69 
 
 
390 aa  77  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  24.01 
 
 
363 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 
367 aa  77  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  29.52 
 
 
365 aa  77  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.07 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.68 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
407 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.41 
 
 
322 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.2 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  24.25 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>