More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0444 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 401 aa  815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.98 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.11 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.91 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.26 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 501 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.5 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2632  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.53 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0377966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 334 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.15 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.25 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 482 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 333 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.58 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.06 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.36 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.03 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 356 aa  87  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.76 
 
 		 491 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3319  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.27 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  24.82 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.69 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  24.26 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.65 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  20.39 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.37 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.16 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.76 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.51 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  22.84 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>