260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2633 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 503 aa  1026    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2632  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.01 
 
 		 474 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0377966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 359 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.78 
 
 		 346 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.09 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 353 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 367 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 358 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 337 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  23.36 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 373 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 363 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  30.58 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.36 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.68 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.42 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.75 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.55 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.98 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.98 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.53 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  33.9 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  29.82 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 406 aa  67  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 406 aa  67  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  22.19 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  30 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.87 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.65 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>