161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2632 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2632  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 474 aa  943    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0377966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.64 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  20.86 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 362 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.46 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.4 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.85 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.48 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.64 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.08 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  22.43 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  21.93 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.89 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  21.01 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  20.65 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  21.04 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  21.04 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.09 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.83 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.09 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  21.59 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.09 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  20.71 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.69 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  19.78 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 350 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  20.33 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  21.54 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  21.04 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  19.58 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 330 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 327 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 497 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  19.84 
 
 		 389 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  19.42 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.7 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  22.46 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  21.51 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  20.59 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  22.97 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 343 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 375 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.99 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  21.95 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  21.77 
 
 		 379 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 382 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 376 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>