More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4009 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.71 
 
 		 479 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.08 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.9 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  38.36 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.35 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.98 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.93 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.7 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 496 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 399 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 409 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.1 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  34.94 
 
 		 422 aa  89.7  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.85 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.65 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  33.74 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 480 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 565 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.48 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  34.34 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  29.94 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.55 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  34.34 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  24.4 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.52 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.14 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.37 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>