More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2641 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 358 aa  748    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  51.03 
 
 		 384 aa  368  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  36.83 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 536 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 537 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 498 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 537 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 529 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.76 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.15 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.5 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.46 
 
 		 479 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.4 
 
 		 491 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 501 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  22.9 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.35 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 405 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.5 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.7 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  23.74 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.97 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.61 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.8 
 
 		 561 aa  90.9  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.09 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  26.74 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 480 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.88 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 510 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  21.87 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  22.65 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  21.64 
 
 		 387 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  22.65 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  24.19 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.33 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  22.65 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  21.55 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  22.25 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  21.55 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>