More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2541 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 498 aa  1029    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  55.47 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  45.98 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  47.97 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  45.89 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  44.7 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  43.62 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  28.12 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 357 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.32 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.91 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 501 aa  100  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.22 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 347 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.03 
 
 		 373 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.06 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 399 aa  90.1  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 480 aa  90.1  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 337 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  27.39 
 
 		 365 aa  89.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.94 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 319 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.86 
 
 		 390 aa  87  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.72 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  24.72 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  24.09 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  24.09 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.72 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.08 
 
 		 410 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.01 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.18 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.27 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.42 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.03 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  24.85 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.23 
 
 		 399 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.64 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>