More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0787 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 537 aa  1103    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  44.78 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  49.15 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  45.47 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 529 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  29.18 
 
 		 357 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 358 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  26.97 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 347 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 337 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 319 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26 
 
 		 373 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  32.83 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 323 aa  87  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  24.73 
 
 		 378 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.73 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  24.73 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  25.14 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.75 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.3 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  25.48 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.18 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.43 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 325 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.74 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.27 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.32 
 
 		 346 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.78 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.57 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30.05 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.57 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.78 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.15 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.96 
 
 		 399 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 396 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.15 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>