255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2458 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 536 aa  1081    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  48.28 
 
 		 537 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  45.98 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  41.65 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  50.73 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  39.06 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 358 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  30.42 
 
 		 357 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  26.63 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 319 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 347 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.83 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  22.5 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  27.1 
 
 		 1014 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.32 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  22.13 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.63 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  26.14 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.07 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.91 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.64 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.17 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  22.74 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.12 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.25 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  23.06 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  23.06 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 1000 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  22.79 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.04 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.52 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  21.34 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>