More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1210 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 529 aa  1082    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  46.85 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2458  radical SAM domain-containing protein  43.43 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  43.8 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  42.8 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 358 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  27.45 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.78 
 
 		 349 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.14 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.44 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  22.87 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  22.87 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  22.59 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.11 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  22.31 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 332 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  22.41 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.82 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.64 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.63 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 367 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  20.97 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 565 aa  67  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.09 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  28.79 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.53 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  21.64 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.03 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.88 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 407 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  24.85 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>