More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1047 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  961    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25 
 
 		 491 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 330 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 317 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 359 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 330 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.56 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 384 aa  96.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 377 aa  95.9  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 418 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.71 
 
 		 346 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 327 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.9 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 380 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.86 
 
 		 379 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 332 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 333 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.43 
 
 		 349 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.65 
 
 		 365 aa  89.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  21.3 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.72 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 358 aa  87  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 396 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.57 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.04 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.81 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1461  Fe-S oxidoreductase-like protein  33.11 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.38 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.74 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.75 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.4 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 1000 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  23.81 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  30.32 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.6 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.6 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>