More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4182 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 367 aa  773    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.31 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 873 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 782 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  24.78 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.98 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 565 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.65 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  31.46 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.79 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  24.43 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 474 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  20.91 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  22.49 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.46 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  20.94 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  21.65 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  21.65 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  22.59 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.06 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  22.61 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.63 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.5 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0871  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.5 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  23.05 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.14 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>