More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1844 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 453 aa  921    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.45 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1461  Fe-S oxidoreductase-like protein  32.21 
 
 		 172 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.24 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  20.51 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  22.52 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  22.67 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 		 364 aa  67  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 321 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  21.57 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  20.51 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  20.21 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.14 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.34 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.07 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  23.87 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.04 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.04 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  20.58 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  23.66 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  21.75 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  19.08 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  25.75 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  20.96 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  25.68 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2623  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.27 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.49 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  21.34 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  22.66 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  20.28 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  21.73 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  20.38 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  19.63 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.91 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  20.42 
 
 		 358 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 316 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.37 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.97 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.43 
 
 		 382 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  18.97 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.03 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 1005 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  23.66 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  20.18 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  20.45 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.87 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  22.02 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.46 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  22.01 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  19.7 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>