More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2362 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  67.63 
 
 		 489 aa  733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  60.94 
 
 		 491 aa  646    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  66.12 
 
 		 487 aa  728    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  58.02 
 
 		 495 aa  644    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 512 aa  1075    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  48.58 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  44.94 
 
 		 495 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  44.98 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  46.32 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 609 aa  431  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  42.3 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  42.12 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  39.36 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  41.8 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 582 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 608 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  31.66 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 447 aa  250  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 492 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.87 
 
 		 459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  33.26 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 436 aa  230  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.89 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  31.7 
 
 		 776 aa  223  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 467 aa  223  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  29.17 
 
 		 706 aa  220  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  30.19 
 
 		 465 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 523 aa  217  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.02 
 
 		 530 aa  216  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 519 aa  200  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  29.37 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  28.21 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.48 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.2 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.71 
 
 		 455 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.8 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.9 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.65 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.34 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.53 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.94 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.06 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.09 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.73 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.88 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.48 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.72 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.71 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.48 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.27 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.48 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.09 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.9 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.52 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.66 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.61 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.95 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>