More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3141 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 441 aa  914    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  50.31 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  50.85 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  50.21 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  50.33 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  51.23 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  49.44 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  51.8 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  48.5 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  50.11 
 
 		 727 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  45.9 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 		 588 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 519 aa  346  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  44.15 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 436 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 496 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  36.16 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  34.73 
 
 		 495 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 609 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.26 
 
 		 506 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  31.97 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 573 aa  239  8e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.18 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 573 aa  237  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 578 aa  236  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  29.86 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.93 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 559 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 530 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 608 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.1 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.99 
 
 		 776 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  31.84 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  31.24 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.35 
 
 		 486 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 582 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  27.73 
 
 		 706 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.63 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.63 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.55 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.55 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.27 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.76 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.79 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.64 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.36 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.46 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  31.02 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.57 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.86 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.01 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.01 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.91 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.12 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.25 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.93 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.99 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.22 
 
 		 339 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.64 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>