More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0637 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 588 aa  1150    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.13 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 		 727 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  46.52 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  43.53 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  44.84 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  44.77 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  43.76 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  41.34 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  41.93 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 519 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  38.45 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 447 aa  320  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 472 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  30.3 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 578 aa  223  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  30.47 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 579 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 		 436 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.82 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 487 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  29.42 
 
 		 569 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.57 
 
 		 561 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  35.03 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.92 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 608 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 581 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 609 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  40.07 
 
 		 776 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 513 aa  173  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  35.93 
 
 		 455 aa  171  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  35.11 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.84 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  36.41 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 582 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.07 
 
 		 706 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.39 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 533 aa  100  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.27 
 
 		 338 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.59 
 
 		 333 aa  86.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.71 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.9 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.22 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.22 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.22 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.22 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.3 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.23 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.64 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.52 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.73 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.78 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.42 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.44 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4885  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.33 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.22 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.88 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.07 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.02 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 340 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 340 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.52 
 
 		 376 aa  67  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.49 
 
 		 337 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 334 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.28 
 
 		 327 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.84 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.55 
 
 		 334 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.95 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.84 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.04 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.93 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.27 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.38 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  30.94 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.44 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.38 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>