More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1614 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 471 aa  960    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  75.75 
 
 		 465 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  91.95 
 
 		 471 aa  886    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  51.42 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  50.21 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  52.28 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  49.08 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  53.26 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 727 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  47.28 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  47.66 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  44.08 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  43.75 
 
 		 543 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  42.28 
 
 		 519 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  43.34 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  38.23 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 		 472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  35.18 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.86 
 
 		 495 aa  256  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  34.37 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 573 aa  247  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 573 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  31.58 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 609 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  32.59 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 512 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 579 aa  237  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  35.15 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 569 aa  223  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.54 
 
 		 776 aa  219  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 474 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.87 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 608 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.92 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 581 aa  199  7.999999999999999e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 513 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  37.41 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 481 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 559 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  30.03 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 533 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.62 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.62 
 
 		 356 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.62 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.47 
 
 		 331 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.8 
 
 		 353 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.23 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.99 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.64 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.61 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.64 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.75 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.37 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.85 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.09 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.33 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  35.71 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.4 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.7 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6446  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.928018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.99 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 		 329 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.47 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>