More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0301 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  989    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  62.5 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  54.65 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  52.65 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  50.78 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  51.33 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  46.37 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  37 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  36.07 
 
 		 776 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 530 aa  276  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  36.09 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.97 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  30.44 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  29.33 
 
 		 561 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  28.99 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.44 
 
 		 506 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 727 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  37.54 
 
 		 514 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 514 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 514 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 489 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 472 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.03 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 513 aa  181  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  35.99 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  35.76 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 573 aa  173  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 573 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 578 aa  171  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  27.29 
 
 		 487 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 608 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 		 569 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 579 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  34.92 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  26.42 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 609 aa  143  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 559 aa  132  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 		 582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.79 
 
 		 706 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.35 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.05 
 
 		 328 aa  67  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.96 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.07 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 1000 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.31 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.28 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.6 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.72 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.36 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.13 
 
 		 341 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.42 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.76 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.32 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.01 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 		 340 aa  57  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.66 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  30.91 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.92 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.19 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.07 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.59 
 
 		 351 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  29.15 
 
 		 336 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>