More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0823 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 463 aa  959    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  58.31 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  53.08 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  51.33 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  51.86 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  50.78 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  46.52 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  36.12 
 
 		 776 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  35.49 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  34.84 
 
 		 530 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 523 aa  286  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.37 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  29.75 
 
 		 561 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 727 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.61 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.54 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  30.44 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 471 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  29.5 
 
 		 495 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 445 aa  193  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 489 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.85 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 609 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.04 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  34.9 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.27 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 573 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 608 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 559 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 543 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 		 588 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 581 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.79 
 
 		 706 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.96 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 1000 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.91 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.52 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.06 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.52 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 380 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.56 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.86 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.48 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.91 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  26.62 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.46 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4135  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.44 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152666 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.74 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.74 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.98 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.46 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>