201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3487 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 316 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  32.97 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 496 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.96 
 
 		 506 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.09 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.89 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.09 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 727 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  26.71 
 
 		 495 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  28.97 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.43 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 608 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  28.42 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 573 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.72 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  25.85 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  31.71 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.53 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.36 
 
 		 706 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.82 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 481 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27 
 
 		 491 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 447 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.11 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2549  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.16 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.41 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  26.42 
 
 		 359 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 530 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.54 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.67 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  33.33 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  24.44 
 
 		 776 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.67 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 468 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.62 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 459 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.94 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 609 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 415 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.68 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.82 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.65 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.84 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.65 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.86 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24.84 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.29 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3201  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.1 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.94 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.56 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  33.33 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.45 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.53 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.83 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 501 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.67 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  30.86 
 
 		 491 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.63 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>