More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0319 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  60.94 
 
 
512 aa  646    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  61.52 
 
 
489 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  62.06 
 
 
487 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1020    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  57.79 
 
 
495 aa  598  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  49.09 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  45.67 
 
 
495 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  47.72 
 
 
609 aa  463  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  50.33 
 
 
472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  46.36 
 
 
573 aa  425  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  45.64 
 
 
573 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 
579 aa  421  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 
578 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 
513 aa  415  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 
559 aa  404  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 
582 aa  395  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 
581 aa  398  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  40.44 
 
 
561 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
569 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 
608 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
727 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
436 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
492 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 
471 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 
458 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  32.58 
 
 
706 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  30.15 
 
 
459 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
453 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
442 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
441 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 
467 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.33 
 
 
465 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.08 
 
 
464 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
519 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 
530 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.71 
 
 
776 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 
523 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.77 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
588 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.85 
 
 
479 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  28.63 
 
 
471 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
463 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.2 
 
 
474 aa  163  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
481 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 
514 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 
514 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.27 
 
 
514 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 
533 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  38.26 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.45 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 
330 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.36 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.48 
 
 
332 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.83 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.44 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.44 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.44 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.13 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.54 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 
399 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.57 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.43 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.27 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.14 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.02 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.49 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.6 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>