More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2134 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 479 aa  991    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  59.31 
 
 		 486 aa  611  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  60.67 
 
 		 474 aa  594  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  57.74 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  58.31 
 
 		 463 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  51.33 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  50.44 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  38.41 
 
 		 776 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 523 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.6 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 533 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.9 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  28.77 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.72 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 489 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.89 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 496 aa  193  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 573 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  30.6 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 578 aa  177  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  35.83 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.85 
 
 		 491 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 579 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 609 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 608 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 		 588 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 581 aa  149  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 582 aa  143  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 559 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  27.65 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  30.37 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.32 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.04 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 1000 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  30.32 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.7 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.5 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4135  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.26 
 
 		 329 aa  57  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.38 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.59 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.1 
 
 		 339 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3490  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.32 
 
 		 317 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.25 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>