More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1813 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 442 aa  908    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  51.56 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  48.44 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  53.26 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  52.07 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  51.19 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 		 727 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  49.89 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  47.95 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  49.21 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  47.53 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  45.01 
 
 		 519 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  43.74 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  48.81 
 
 		 543 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  35.93 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.92 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 489 aa  239  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.06 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 487 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 609 aa  227  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 569 aa  226  9e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  30.23 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.97 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 579 aa  216  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 573 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  33.85 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 		 530 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.33 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  29.11 
 
 		 561 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 523 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 608 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  30.44 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.62 
 
 		 776 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  31.02 
 
 		 486 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 559 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  25.86 
 
 		 706 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 514 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  30.03 
 
 		 514 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 514 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.59 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  22.27 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.61 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.95 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.39 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.88 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.74 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.7 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.77 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.7 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.46 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.6 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.99 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.94 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.74 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.15 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.22 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.19 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.46 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4135  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152666 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.78 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>