More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1106 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  64.54 
 
 
489 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  100 
 
 
495 aa  1035    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  63.43 
 
 
487 aa  682    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  58.02 
 
 
512 aa  644    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  57.79 
 
 
491 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  47.96 
 
 
506 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  45.53 
 
 
495 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  48.39 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  50.11 
 
 
472 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  45.93 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 
513 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
559 aa  404  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  41 
 
 
561 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 
573 aa  395  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
581 aa  389  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 
579 aa  389  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  41.5 
 
 
582 aa  385  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 
573 aa  388  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 
569 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  37.95 
 
 
608 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 
453 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
447 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  34.73 
 
 
441 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 
727 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  34.14 
 
 
492 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 
471 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  33.55 
 
 
445 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 
471 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 
470 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  33.26 
 
 
459 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 
436 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 
442 aa  242  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.99 
 
 
465 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 
467 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.26 
 
 
464 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
441 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  29.08 
 
 
706 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 
519 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.62 
 
 
776 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
543 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
523 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.11 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  30.08 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
481 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 
463 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  30.63 
 
 
471 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  28.72 
 
 
486 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  28.45 
 
 
474 aa  190  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 
588 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  25.2 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 
399 aa  87.4  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.49 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.76 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  32.35 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  28.78 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.01 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.63 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  36.04 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.17 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.65 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3146  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  24.69 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.36 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.21 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.53 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  30 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.35 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.57 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.23 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.77 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.14 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.43 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.84 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>