198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4322 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  100 
 
 		 514 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  67.77 
 
 		 533 aa  700    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1041    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  32.51 
 
 		 471 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  32.66 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.19 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.46 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.91 
 
 		 776 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  35.83 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 530 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.11 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.05 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  23.44 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 512 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 727 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  23.09 
 
 		 513 aa  120  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 441 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  25.2 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  23.27 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 569 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 519 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  23.58 
 
 		 706 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.76 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  22.43 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  30.98 
 
 		 588 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  26.63 
 
 		 1014 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 1000 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 1005 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 800 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 344 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 326 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  30.33 
 
 		 314 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 565 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  30 
 
 		 595 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.35 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.67 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 427 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.71 
 
 		 234 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  27.32 
 
 		 344 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  26.32 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.43 
 
 		 326 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.02 
 
 		 317 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.16 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.09 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.34 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.53 
 
 		 326 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  31.93 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 332 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.16 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>