More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3378 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1219    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  48.82 
 
 		 579 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  59.34 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  56.87 
 
 		 314 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  57.33 
 
 		 330 aa  356  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04180  hypothetical protein  40.38 
 
 		 274 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1612  putative phosphatase  43.18 
 
 		 268 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.481085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  32.24 
 
 		 254 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  31.84 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.78 
 
 		 239 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  29.33 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  30.43 
 
 		 233 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.92 
 
 		 222 aa  97.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  29.17 
 
 		 636 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  27.54 
 
 		 259 aa  94  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 240 aa  91.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.75 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.33 
 
 		 232 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.33 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  29.81 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  30 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  26.82 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.23 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.36 
 
 		 234 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.64 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  29.84 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.17 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.97 
 
 		 222 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  32.67 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  25.1 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  25.48 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 271 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  22.39 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  25.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  27.56 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  30.59 
 
 		 244 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  30.59 
 
 		 244 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  29.87 
 
 		 681 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  23.26 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  25.98 
 
 		 271 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  29.53 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.88 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.86 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  29.13 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.77 
 
 		 243 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4037  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 235 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 332 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 1000 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  27.19 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  21.79 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  28.06 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  29.69 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  33.61 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2032  metallophosphoesterase  24.63 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 1005 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  26.74 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  27.44 
 
 		 281 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  25.33 
 
 		 351 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  21.33 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  30.87 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 244 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  26.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.81 
 
 		 235 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  27.78 
 
 		 365 aa  56.2  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  24.38 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 327 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 244 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 381 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 389 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 249 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 246 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1115  metallophosphoesterase  24.42 
 
 		 216 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0817094  decreased coverage  0.00169926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 409 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  29.66 
 
 		 247 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 334 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  29.34 
 
 		 246 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 327 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 351 aa  54.3  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 377 aa  54.3  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 501 aa  53.9  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  24.72 
 
 		 241 aa  53.9  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  30 
 
 		 244 aa  53.9  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3673  metallophosphoesterase  25.85 
 
 		 234 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>